新京报讯(xun) 据中国农业(ye)科学院网站消息(xi),近日,中国农业(ye)科学院北京畜(chu)牧兽医研究所猪遗传育种科技创新团队联合国内科研单位,从猪端粒到(dao)端粒(T2T)基因组组装、图形泛基因组构建及耐寒耐热基因挖掘(jue)等(deng)方面,全面系统地揭示了(le)猪端粒到(dao)端粒基因组研究的重要价值及广(guang)泛应用前景。相关研究成果发表在《宏(hong)(iMeta)》上。
当(dang)前,国际猪参考基因组根据杜(du)洛克猪组装而成,但目前的参考基因组组装并未达(da)到(dao)端粒到(dao)端粒水平,限制了(le)猪基因组学的发展。我(wo)国拥有丰富的猪种资源,其中来自东北冰冷地区的民(min)猪和来自重庆湿热地区的荣昌猪分别是强耐寒和强耐热的代表性猪种。该研究组装了(le)民(min)猪和荣昌猪两(liang)个地方猪种的端粒到(dao)端粒基因组,并对端粒和着丝粒区域的结构特征(zheng)提出了(le)新见解。
研究人员通过泛基因组分析识别了(le)25472个基因家族和194234个高质量结构变异(yi),构建了(le)图形泛基因组。通过多组学数据整(zheng)合,发现了(le)民(min)猪耐寒的关键基因TPT1和荣昌猪耐热的关键基因GIMAP6,并在荣昌猪GIMAP6基因上游发现了(le)一个可能增强荣昌猪耐热性的关键突变。此外,构建的图形泛基因组进一步提高了(le)全基因组关联分析数量性状基因座的数量,并提升了(le)全基因组选择育种的准确性。研究对猪气候适应性研究及相关育种工(gong)作提供了(le)理论(lun)依据和技术支撑。
编辑 张树婧