新京(jing)报讯(xun) 据中国农业科学院网站消(xiao)息,近日,中国农业科学院北(bei)京(jing)畜牧(mu)兽医研究所猪遗传育种科技创(chuang)新团(tuan)队联合国内(nei)科研单位,从猪端粒到端粒(T2T)基因组组装、图形泛基因组构建及(ji)耐寒耐热基因挖掘等方面,全面系统地揭示了猪端粒到端粒基因组研究的重要价值及(ji)广泛应用前景。相关研究成果发表在《宏(iMeta)》上。
当(dang)前,国际(ji)猪参考基因组根据杜洛克猪组装而成,但目前的参考基因组组装并未达到端粒到端粒水平,限制了猪基因组学的发展。我国拥有丰富的猪种资(zi)源,其中来自东(dong)北(bei)冰冷地区的民猪和来自重庆湿热地区的荣昌猪分别是强(qiang)耐寒和强(qiang)耐热的代表性猪种。该研究组装了民猪和荣昌猪两个地方猪种的端粒到端粒基因组,并对端粒和着丝粒区域的结构特征提出了新见解。
研究人员(yuan)通过(guo)泛基因组分析识别了25472个基因家族和194234个高(gao)质量结构变异,构建了图形泛基因组。通过(guo)多组学数据整合,发现(xian)了民猪耐寒的关键基因TPT1和荣昌猪耐热的关键基因GIMAP6,并在荣昌猪GIMAP6基因上游发现(xian)了一个可能增强(qiang)荣昌猪耐热性的关键突变。此外,构建的图形泛基因组进一步提高(gao)了全基因组关联分析数量性状基因座的数量,并提升了全基因组选择育种的准(zhun)确性。研究对猪气候适应性研究及(ji)相关育种工作提供了理论依据和技术(shu)支(zhi)撑。
编辑 张(zhang)树婧